Le fumier et le lisier sont souvent utilisés comme matières premières pour la production de biogaz dans un méthaniseur. Le processus de méthanisation consiste à décomposer la matière organique en l'absence d'oxygène, ce qui produit du biogaz contenant du méthane et du dioxyde de carbone. Le biogaz ainsi produit peut être utilisé pour produire de l'électricité, de la chaleur, du carburant et d'autres produits.

Les avantages de l'utilisation du fumier et du lisier dans un méthaniseur sont nombreux. Tout d'abord, cela permet de valoriser ces déchets organiques en produisant de l'énergie renouvelable. Le fumier et le lisier sont souvent considérés comme des déchets polluants et difficiles à traiter, mais leur utilisation dans un méthaniseur permet de les transformer en une ressource précieuse. Les éleveurs ont un intérêt particulier à les valoriser, puisqu'ils sont produits de manière continue par leur activité d'élevage. 

La production de biogaz à partir de fumier et de lisier permet de réduire les émissions de gaz à effet de serre. En effet, la méthanisation permet de capturer le méthane produit par la décomposition de la matière organique et de le transformer en une source d'énergie renouvelable, évitant ainsi sa libération dans l'atmosphère.

L'utilisation de fumier et de lisier dans un méthaniseur peut contribuer à la réduction des coûts d'élimination des déchets. En effet, plutôt que de devoir payer pour épandre ces produits, les agriculteurs peuvent les utiliser pour produire de l'énergie.

L'inconvénient de ces produits est leur faible teneur en biogaz et donc leur faible pouvoir méthanogène. Cependant, ils apportent une stabilité à la biologie avec une composition organique idéale pour le développement des bactéries en milieu anaérobie.